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7: Interlude - Coletando e gerenciando dados


Dados são informações. De forma otimista, corremos o risco de perder muito tempo tentando reestruturar os dados para permitir o tipo de análise que desejamos realizar; pior ainda, corremos o risco de comprometer a integridade ou, Deus me livre, a perda total de dados por meio de uma estruturação inadequada e gerenciamento incorreto.

Primeiro, vamos ser claros sobre o que se entende por estrutura de dados e gerenciamento de dados:

Estrutura de dados refere-se à organização e layout de dados como
ele é armazenado. Quer sejam manuscritos em cadernos ou armazenados em planilhas ou arquivos de texto, os dados geralmente possuem uma arquitetura que reflete as intenções (ou desconhecimento) do gestor de dados ou às vezes os protocolos de sua organização ou instituição.

Gestão de dados é o conjunto de práticas que visam preservar a qualidade, integridade e acessibilidade dos dados. Isso pode incluir todas as fases de uso de dados, desde a coleta e manipulação até o armazenamento, compartilhamento e arquivamento.

Recurso

Existem alguns recursos excelentes para gerenciamento de dados em várias formas, incluindo alguns voltados para biólogos. Alguns ótimos são:

Data Carpentry https://www.datacarpentry.org Wickham, H., 2014, Tidy Data. Journal of Statistical Software 59 (10). Saltz, J.H. e J.M. Stanton, 2017, Introdução à Ciência de Dados, Sage publ.

7.1 Para quem são os dados?

A menos que você trabalhe com informações altamente classificadas ou proprietárias e seja obrigado a proteger e codificar seus dados, provavelmente precisará que os dados sejam facilmente compreendidos e utilizáveis, não apenas para você, mas para outras pessoas com quem trabalha ou para o público em geral (^ {1} ). Mas também precisamos perceber que os humanos que precisam entender os dados usarão ferramentas como computadores para facilitar essa abordagem. Portanto, a estrutura de dados também precisa acomodar as demandas do hardware e software do computador em que é usado, bem como os humanos. Assim, os dados devem ser organizados de forma lógica e autoconsistente e devem ser acompanhados de documentação que ajude a explicar o conteúdo e o contexto dos dados. Da mesma forma, o arquivamento de dados acessíveis, em princípio, permite que colegas e concorrentes testem, verifiquem, reproduzam e / ou comparem os resultados com os seus próprios, garantindo que os avanços científicos que você faz com a ajuda de seus dados também podem levar ao avanço da ciência e gestão mais ampla.

Elemento 1.

(^ {1} ) Muitas agências de financiamento do governo, como a National Science Foundation, o US Department of Agriculture e o National Institutes of Health agora exigem que os pesquisadores desenvolvam um plano de gerenciamento de dados que inclui estratégias para estruturar, arquivar e indexar dados publicamente -repositórios acessíveis.

Considere o fluxo de trabalho esquemático ilustrado na Figura 7.1. Uma vez coletados, os dados devem ser organizados e formatados de forma que facilite sua análise no computador. Um termo popular para dados formatados para simplificar a manipulação do computador é dados organizados (mais sobre isso abaixo). Quando esse processo estiver concluído, os dados podem ser analisados ​​conforme necessário para resolver o problema ou hipótese em questão. Esse processo de dar sentido aos dados pode, então, produzir um resultado que precisa ser comunicado aos humanos. Quando os dados são apresentados pelo olho e pelo cérebro humanos, a organização e a estrutura devem refletir as expectativas e a capacidade de atenção dos humanos. A menos que o conjunto de dados seja pequeno, os dados brutos ou transformados podem não ser apropriados para exibição. Em vez disso, os dados resumidos são mais apropriados, seja em narrativa, tabela ou formato gráfico.

7.2 Dados organizados

Para entender o significado da limpeza, talvez seja útil considerar dados desordenados ou desordenados. Abaixo está uma parte de uma tabela de dados contendo os pesos e comprimentos de pequenos peixes capturados durante um levantamento populacional de Inch Lake, Wisconsin. Vamos descompactar esse conjunto de dados. Existem duas espécies diferentes de peixes listadas, uma observada em 2007 e 2008 e outra apenas em 2007. Os comprimentos e larguras são fornecidos para todos os peixes medidos, mas há diferentes números de

peixes em cada coluna. Também existe um valor de índice na primeira coluna que facilita a contagem do número de peixes de cada espécie capturados em cada ano. Isso é razoavelmente simples para um ser humano interpretar, especialmente se nos for dito que L corresponde a um comprimento em polegadas e W corresponde a um peso em gramas. No entanto, seria difícil analisar um conjunto de dados maior organizado como esta tabela por uma variedade de razões, incluindo:

• as colunas não têm o mesmo número de valores

• a mesma espécie tem dados em várias colunas

• duas variáveis ​​(comprimento e largura) são listadas juntas dentro de cada coluna, com números e letras misturados

Uma pergunta instrutiva a fazer é quantas variáveis ​​existem aqui. Percebemos que os dados abrangem vários anos, portanto, o ano pode ser uma variável. Existem também várias espécies aqui, então as espécies podem ser vistas como uma variável. Então, o comprimento e a largura devem ser variáveis. Finalmente, se quisermos ter um índice ou número de ID para cada peixe, isso pode ser uma quinta variável (^ {3} ). Em geral, os dados organizados são organizados em uma matriz retangular em que cada coluna representa uma variável e cada linha uma observação. Na maioria dos casos, a primeira linha contém cabeçalhos de coluna descritivos, mas simples. Essa prescrição simples não parece ameaçadora, mas muitas vezes é surpreendente como os dados desordenados são generalizados.

Elemento 3.

(^ {3} ) Se houver vários conjuntos de dados derivados do mesmo grupo de peixes, atribuir um número de ID de peixe seria uma maneira simples de conectar esses conjuntos de dados usando métodos de banco de dados.

Portanto, com cinco variáveis, quantas observações temos? Cada peixe representa uma observação, com um número de identificação único, ano de captura, espécie, peso e comprimento. Na Tabela 7.2, parece haver dez peixes listados entre as três colunas. então, uma vez que cada peixe é uma observação. De acordo com os princípios de dados organizados, então, deve haver dez linhas de dados com valores em cada uma das cinco colunas. Abaixo está uma representação organizada deste conjunto de dados. Esta tabela agora está organizada de uma forma que pode ser facilmente classificada, filtrada e resumida em estatísticas comuns e pacotes de software computacional.

Dados organizados

Os dados do Tidy têm:

• uma coluna para cada variável

• uma linha para cada observação

• uma linha de cabeçalho

7.3 Gestão de dados

Como os dados costumam ser o resultado conquistado a duras penas de observações e medições caras e demoradas, seu gerenciamento deve ser deliberado e cuidadoso. Dados bem gerenciados podem ser armazenados, recuperados, analisados ​​e usados ​​para desenvolver percepções ou auxiliar nas decisões de gerenciamento sem comprometer os dados em si e sem gastar tempo e energia desnecessários na decodificação e interpretação dos dados brutos. Portanto, o gerenciamento adequado envolve não apenas uma estrutura cuidadosa, conforme descrito acima, mas também um armazenamento bem organizado e documentação completa.

Primeiro, dados brutos importantes devem ser armazenados de forma redundante. Se estiver apenas em cópia impressa (por exemplo, em cadernos de campo), considere digitalizar ou transcrever os dados da cópia impressa para preservar uma versão digital que pode ser copiada regularmente. Quando os dados resultam de pesquisas originais que podem ser compartilhados, eles podem ser carregados para os dados. Um conjunto completo de dados deve ser arquivado e nunca modificado, enquanto a redução e análise de dados são feitas em cópias dos dados brutos formatados.

Elemento 4.

(^ {4} ) Repositórios de dados como o LTER Data Portal requerem dados formatados e metadados para garantir acessibilidade de longo prazo e documentação adequada.

Quando a análise ou redução ocorre muito depois do momento da coleta e armazenamento, ou é feita por uma pessoa ou grupo diferente do pesquisador que coletou os dados, a documentação ou metadados adequados são essenciais. Os metadados podem incluir descrições narrativas de onde os dados foram coletados, quando e como foram coletados, e devem incluir referências ou links para qualquer pesquisa publicada ou disponível publicamente ou informações derivadas dos dados. Os metadados devem sempre incluir um dicionário de dados, descrevendo completamente as quantidades representadas por cada uma das variáveis ​​coletadas (ou seja, nome da variável, símbolo, unidades e instrução de procedimento). Essas diretrizes garantem que os dados permaneçam seguros, úteis e acessíveis.


O fardo da doença de Ras

Ian Prior recebeu seu Ph. D. da University of Liverpool, onde, após um interlúdio de pós-doutorado com John Hancock na University of Queensland, ele agora está de volta como chefe do Departamento de Fisiologia Molecular e Sinalização Celular, e North West Cancer Research Chair of Molecular Oncology.

Sempre fiquei impressionado com a falta de consenso em torno das taxas de mutação de Ras no câncer, com estimativas que variam de

10% a & gt30%. Parecia algo que já deveríamos saber, após um período tão longo de investigação e os bancos de dados de genética do câncer em grande escala que foram desenvolvidos. Existem discrepâncias semelhantes nas estimativas para as taxas de mutação em cânceres Ras comuns com câncer pancreático variando de 70% a 98% e câncer de pulmão e colorretal variando de 25% a 50%. Em um artigo publicado recentemente em Pesquisa sobre câncer [1], explicamos a base para essas diferenças e sugerimos uma maneira de estimar com mais precisão a carga da doença Ras.

Os bancos de dados e portais de dados cBioPortal, COSMIC, TCGA e ICGC são todos excelentes recursos para investigar as taxas de mutação e outras alterações genéticas em genes de interesse em um amplo espectro de tipos de câncer. Cada banco de dados tem pontos fortes específicos em termos de escala, consistência de curadoria, a gama de mudanças genéticas que foram mapeadas e a proporção de amostras que foram submetidas à análise de todo o genoma. Cada um deles dá um valor diferente de taxas de mutação Ras (H + K + N) variando de

25% em COSMIC. Uma das principais razões para essas diferenças é devido às diferentes composições dos bancos de dados, aqueles que contêm mais amostras de cânceres mutantes KRAS comuns têm estimativas mais altas. É importante ressaltar que as composições dos bancos de dados não refletem a incidência relativa de cada tipo de câncer na população, o que significa que suas estatísticas de nível superior não estimam diretamente a carga da doença. Os tipos de câncer individuais também mostram uma gama de estimativas para um determinado gene Ras, por exemplo, as taxas de mutação KRAS no câncer de pâncreas variaram de 58% a 80% nos bancos de dados. Nenhum desses valores está perto da frequência de mutação & gt90% que todos nós normalmente citamos. O banco de dados privado Foundation Medicine (FM) sugere uma razão para essa discrepância quando as amostras de câncer de pâncreas são selecionadas para excluir aqueles com conteúdo estromal significativo, a taxa de mutação KRAS é

A fim de tentar desenvolver um consenso para a carga da doença Ras, convertemos as frequências de mutação Ras dos maiores bancos de dados (COSMIC e dados de FM disponíveis publicamente) em números de pacientes para cada tipo de câncer com base nas estatísticas atuais de incidência de doenças da American Cancer Society. Nós achamos isso

19% de todos os pacientes com câncer nos Estados Unidos possuem uma mutação Ras, equivalente a

250.000 novos casos por ano nos Estados Unidos. Existem ressalvas em extrapolar esta estimativa com base nos EUA para um contexto global devido às diferentes frequências geográficas de tipos distintos de câncer, no entanto, 19% dos casos de câncer globais é equivalente a

3,5 milhões de novos pacientes com câncer mutante Ras por ano.

Os 20 principais cânceres nos Estados Unidos em termos de número de pacientes mutantes Ras podem ser vistos na Tabela 1. Uma característica desse tipo de análise é que ela destaca os grupos significativos de pacientes que podem se beneficiar de alguns dos atuais Ras- ensaios clínicos relevantes. Por exemplo, os ensaios clínicos em andamento dirigidos por HRAS de terapias com inibidores da farnesiltransferase enfocaram os tipos de câncer em que as frequências de mutação do HRAS são relativamente altas, como sangue de cabeça e pescoço e câncer de tireoide. Na verdade, o

1.600 pacientes com câncer de mama mutante HRAS nos EUA se traduzem em

12.000 casos em todo o mundo que também podem se beneficiar com esses tratamentos em uma doença que normalmente não é considerada tão diretamente relevante para o Ras.

Embora esta análise se concentre na carga de doenças do câncer Ras, as contribuições de Ras para RASopatias também são importantes. Bancos de dados genéticos para essas doenças também estão sendo desenvolvidos, com o banco de dados NSEuroNet coordenado por Martin Zenker representando um exemplo importante. A aplicação de uma abordagem semelhante de conversão de frequências de mutação em números de pacientes estima que

5% dos pacientes com RASopatia apresentarão uma mutação em uma das isoformas Ras, equivalente a até 400.000 pessoas em todo o mundo. Isoforma interessante e padrões específicos de mutação também estão se tornando evidentes no banco de dados NSEuroNet, que destacam a complexidade da biologia da variante Ras em todas as doenças mutantes Ras.

Esperançosamente, esses números fornecem um pouco de reflexão. No mínimo, agora sei que porcentagem irei citar na próxima vez que me inscrever para financiamento.

Referências Selecionadas

Anterior IA, Hood FE e Hartley JL, 2020. A frequência das mutações Ras no câncer. Pesquisa sobre câncer.

Singhi AD, George B, Greenbowe JR, Chung J, Suh J, Maitra A, Klempner SJ, Hendifar A, Milind JM, Golan T, Brand RE, Zureikat AH, Roy S, Schrock AB, Miller VA, Ross JS, Ali SM , Bahary N. 2019. A análise do perfil do genoma direcionado em tempo real dos adenocarcinomas do duto pancreático identifica as alterações genéticas que podem ser direcionadas aos medicamentos existentes ou usadas como biomarcadores. Gastroenterologia

Células de origem alternativas influenciam a heterogeneidade do adenocarcinoma de pulmão mutante KRAS

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Interlúdio 7

& ltWalk! & gt o soldado latiu em turco. Ele enfiou a arma entre as omoplatas dela, com força. Ele era duas vezes mais alto que ela, muito mais forte do que ela, então não poderia haver luta ou resistência, mesmo se ele não estivesse armado. Ela tropeçou em direção aos arbustos e árvores, e os galhos arranharam seus antebraços e rosto.

Um pé na frente do outro, Hana disse a si mesma. Seus pés eram como pesos de chumbo enquanto ela avançava com dificuldade. As agulhas nas árvores e arbustos arranharam sua pele. Até os galhos eram ásperos, quase espinhosos, agarrando-se ao vestido e às meias, cortando o tecido para arranhar sua pele e apunhalá-la nos pés descalços.

& ltMais rápido! & gt o soldado ameaçou. Ele disse outra coisa, mais longa e complicada, mas o turco de Hana não era bom o suficiente para entender. Ela olhou por cima do ombro e viu o homem de volta por onde ela havia vindo. Ele deixou seu significado claramente claro balançando sua arma em direção às outras crianças, que estavam encurraladas no meio de meia dúzia de outros soldados. Se ela não se movesse mais rápido, outra pessoa pagaria por isso.

Sete anos haviam dado falsa confiança à sua aldeia, fazendo-os acreditar que estavam longe o suficiente, isolados o suficiente no vale e na floresta, para que pudessem escapar dos piores combates da guerra em andamento. Essa ilusão foi destruída apenas algumas horas atrás.

Ela estava escondida no porão ao lado de sua casa. Ela tinha ouvido os gritos e tiros. Muito tiros, considerando quão poucas armas de trabalho os homens e mulheres de sua aldeia tinham. Armas e balas eram muito caras quando você vivia de seu jardim e do que podia caçar, e uma viagem à cidade mais próxima para comprar essas coisas era perigosa. O que tinham eram as sobras, o punhado de armas tiradas dos inimigos pelos guerrilheiros e deixadas para trás ou trocadas em troca quando passavam pela aldeia em busca de suprimentos e cuidados médicos. Aqueles que tinham as armas não tinham habilidade ou treinamento para usá-las. Os lutadores deveriam defendê-los contra pessoas assim, impedi-los de chegar tão longe.

Ela correu para dar mais um passo à frente e se encolheu quando um galho quebrou sob os pés. O menor dos gemidos escapou de seus lábios.

Quando os soldados inimigos a encontraram no porão, arrastaram-na para um grupo com as outras nove crianças de sua aldeia, ela sabia que seus pais já estavam mortos ou morrendo. Enquanto os soldados os levavam pela aldeia e pela floresta, ela olhou fixamente para o chão, com lágrimas escorrendo pelo rosto, sem vontade de olhar para o sangue, os corpos, que espalhavam-se por sua cidade natal. Pessoas que ela tinha visto todos os dias de sua vida.

Seus olhos percorreram o chão da floresta, mas ela não tinha ideia do que procurar. Uma protuberância de terra? Twine? Uma área densa de agulhas marrons e secas? Ela deu mais um passo à frente, esperou pelo desastre. Quando não veio, ela deu um passo à frente novamente, fez uma pausa.

Há pouco tempo, ela observara à distância Kovan, o menino mais velho e gordo que uma vez a chamou pelo nome, deu um passo à frente e teve sua perna caindo em um buraco. Ele gritou, e quando Hana e o resto das crianças correram para tentar levantá-lo, só aumentaram o volume de seus gritos e a ferocidade de sua surra. Com os soldados turcos observando silenciosamente atrás deles, Hana e os outros usaram as mãos para raspar a terra dura e rochosa, revelando as estacas de madeira que estavam alojadas nas laterais do buraco. Cada um foi colocado na terra de forma que eles apontassem para baixo em um ângulo, com alguns na parte inferior para perfurar seu pé. Flexível, a madeira tinha se dobrado o suficiente para permitir que a perna caísse profundamente no buraco, mas as tentativas de levantar Kovan apenas puxaram sua perna e pé para cima em pontas de madeira à espera.

Era, ela sabia, uma das armadilhas colocadas pelos caçadores de sua aldeia & # 8217s ou pelos guerrilheiros que defendiam sua aldeia. Eles estavam por toda parte, espalhados pela floresta, ao redor de sua aldeia, perto de estradas e outros lugares importantes. Ela ouviu um dos lutadores descrevendo essa mesma armadilha para seu pai. Disseram-lhe, repetidamente, que ela não devia brincar na floresta por esse motivo, que se ela tivesse que viajar para a floresta por qualquer motivo, ela precisava de um adulto para guiá-la. A realidade total disso não havia sido registrada até que ela viu o que havia acontecido com Kovan.

Eles haviam tentado por muito tempo libertar a perna do menino, sabendo que, à medida que descobriam mais e mais sua perna perfurada, viam os ferimentos e a quantidade de sangue, ele não seria capaz de andar muito . Eles sabiam que era inútil, mas Kovan era alguém com quem haviam estudado. Alguém que eles viam todos os dias.

Um soldado pôs fim a seus esforços com uma bala na cabeça de Kovan & # 8217, fazendo de Kovan a segunda criança a morrer.

Hana foi escolhida para ir a seguir. Para testar o caminho.

Ela agarrou a frente do vestido, enrolando o tecido com as mãos que ainda estavam cobertas de sujeira e arranhões de seus esforços para libertar Kovan. Um pé na frente do outro. Cada um de seus sentidos estava no limite. Ela estava hiperconsciente do farfalhar de sujeira sob os pés, o raspar das agulhas de pinheiro contra o tecido de seu vestido. Ela podia sentir o calor do sol aquecendo sua pele quando ela pisou em um local onde a luz se filtrava através dos pinheiros.

Ela piscou com força para limpar os olhos das lágrimas. Tão estúpido. Ela precisava ser capaz de ver. Qualquer pista. Qualquer coisa, para ver uma armadilha. Chorar era a pior coisa que ela poderia fazer.

Um pé na frente do outro.

Ela parou. Seus pés se recusaram a ir mais longe. Tremendo, ela olhou ao redor.

Se ela desse mais um passo, ela sabia, ela ia morrer.

Não havia nenhuma razão para isso, nenhuma razão ou pista. Este pedaço de floresta não era diferente do resto. Uma cama de agulhas marrom-avermelhadas sob os pés, arbustos e árvores pressionando ao redor dela.

Mas ela sabia. Se ela desse um passo à frente, para a direita ou para a esquerda, ela estaria caindo em uma armadilha. Um buraco como o que pegou Kovan, ou talvez um dispositivo explosivo, como o que pegou Ashti. Pelo menos ela se foi rapidamente.

O soldado que a observava gritou atrás dela, o sempre familiar & ltWalk! & Gt que era uma ameaça e uma ordem ao mesmo tempo.

Doente de medo, Hana olhou em volta, procurando por algo que pudesse dizer a ela para onde ir, como se mover.

Naquele momento, ela sabia que não iria morrer imediatamente. Ela não conseguia andar mais, era fisicamente impossível, como se seus pés estivessem tão enraizados no chão quanto as árvores. Eles a fariam assistir enquanto torturavam uma das outras crianças até a morte. Então, eles iriam começar no próximo, talvez a própria Hana, até que eles tivessem outro filho disposto a agir como isca e limpar as armadilhas de seu caminho da maneira mais simples e perigosa possível.

Não era grande no sentido de que as árvores ou mesmo as montanhas eram grandes. Era grande de uma maneira que transcendia o que ela podia ver ou sentir. Foi como ver algo maior do que todo o vasto planeta, exceto mais & # 8211 essa coisa que era grande demais para se compreender para começar, ela se estendeu. Ela não tinha palavra melhor para descrever o que estava percebendo. Era como se houvesse imagens espelhadas dela, mas cada imagem existia no mesmo lugar, algumas se movendo de forma diferente e, às vezes, muito raramente, uma imagem entrava em contato com algo que as outras não. Cada uma das imagens era tão real e concreta quanto as outras. E isso cresceu de uma forma que ela não poderia descrever se fosse uma acadêmica ou filósofa centenária com acesso às melhores bibliotecas do mundo.

E foi vivo. Uma coisa viva.

Ela sabia, sem ter que pensar sobre isso, cada um desses ecos ou extensões da entidade era tão parte de um todo conectado quanto sua mão ou nariz eram para ela. Cada um era algo do qual esta entidade viva estava ciente, controlada e movida com intenção e propósito. Como se ela existisse e se estendesse a esses eus possíveis de uma só vez.

Está morrendo, ela pensou. As extensões externas da criatura estavam se descamando e se quebrando em fragmentos enquanto nadava por um vazio sem ar, sem se mover, mas se ajustando sinuosamente através das existências que continham os ecos, encolhendo aqui e inchando ali, levando-se a uma velocidade aquela luz ultrapassada. Em sua esteira, flocos e fragmentos se desprenderam da entidade como sementes de um impossivelmente grande Karahindiba, ou dente de leão, em um vento constante. Sementes mais numerosas do que todas as partículas de sujeira em toda a Terra.

Um desses fragmentos parecia crescer, ficando cada vez maior, pairando em sua consciência até ser tudo o que ela podia perceber, como se a lua estivesse caindo, colidindo com a terra. Caindo diretamente em cima dela.

-k! & gt o soldado terminou sem perder o ritmo.

Hana se mexeu, ela ainda estava na floresta, as mãos ardendo com os arranhões, os pés doloridos de tanto caminhar. Seu coração batia forte e ela podia sentir o gosto de medo como bile em sua boca.

A memória já estava sumindo. Isso tinha acontecido? Por mais que ela lutasse para retê-lo, ele estava se esquivando dela. Foi como um sonho que escapou dela quando ela acordou, mas tão escorregadio que até mesmo a ideia que ela havia sonhado em primeiro lugar estava rapidamente se retirando de sua mente.

O soldado gritou algo muito complexo para ela entender, dirigido a seus companheiros. Hana deixou que os fragmentos da memória escapassem de sua atenção. Essa, aqui, era a prioridade. Ou ela avançava e morreria, ou ficava parada e observava os outros morrerem por sua covardia. Com apenas o vestígio de uma ideia de que algo havia acontecido, ela foi sacudida por sua paralisia. Talvez ela pudesse dar um passo à frente.

E parou. Algo estava em seu caminho. Um borrão pairou no ar na altura do peito, estalando, mudando com uma ferocidade maníaca. Ela deixou o pé cair de volta onde estava um momento atrás e olhou para o brilho caleidoscópico de preto e verde.

Ela o tocou e sentiu um peso se instalar em sua palma. Sua mão automaticamente fechou em torno dele, sentindo o calor dele. Era quase como quando ela acaricia um cachorro amigável. Um pensamento estranho, dado o que ela se viu olhando.

Uma arma de aço cinza polido. De alguma forma familiar. Idênticas às menores armas que ela vira os guerrilheiros portando.

Não consigo usar isso. O pensamento estava frio em sua mente. Se eu usar isso, eles matarão os outros no segundo que eu atirar.

A arma tremeluziu, tornou-se aquele borrão de verde e preto, então assumiu uma nova forma. Ela também tinha visto isso. Um dos lutadores estava conversando com Hana, mostrando a ela sua revista de armas em inglês, em um esforço para ficar nas boas graças de sua irmã mais velha. Era semelhante à arma que ela acabava de ter na mão, mas havia um tubo de metal na frente, quase dobrando o comprimento da arma. O tubo, ela sabia, tornava as armas mais silenciosas.

O resto das crianças e os outros soldados estavam bem atrás. Ainda era quase impossível, mas-

& ltWalk! & gt o soldado atrás dela gritou. & ltWalk or- & gt

Ela se virou, segurando a arma com as duas mãos. Ela levou um segundo para estabilizar a mira, e a surpresa do soldado turco # 8217 deu a ela tempo suficiente para puxar o gatilho.

Os olhos de Hannah se abriram de repente.

Ela ainda estava vestindo sua fantasia, ela notou, enquanto se levantava da cama e caminhava para o banheiro. Pelo menos ela teve o bom senso de remover o lenço para não estrangular enquanto descansava.

Ela foi a única que se lembrou. Todo mundo esqueceu aquele ser impossivelmente enorme, se eles foram agraciados com um vislumbre dele. Ela não tinha certeza. Se qualquer outra pessoa visse, eles inevitavelmente esqueceriam antes que pudessem reunir seus pensamentos o suficiente para falar sobre isso. Como ela deveria fazer.

Mas ela se lembrou. Ela tocou a faca de combate que estava embainhada em seu quadril, como se para lembrar a si mesma que ela estava ali. Ela nutria suas suspeitas sobre seu dom: seus poderes haviam tomado uma parte de sua psique e lhe dado uma forma concreta. As partes mais raivosas dela, as partes mais infantis, as partes dela que sonharam e aquelas que esqueceram. A faca em seu quadril dormia por ela e sonhava por ela, ela imaginava. Ela passou quase um ano de cada vez sem precisar parar e colocar a cabeça para descansar em um travesseiro.

Quando ela fechou os olhos e se deixou cair no sono, foi porque sentiu que era algo que ela deveria para fazer, não porque ela tinha que fazer. Mesmo assim, ela nunca sonhou. Ela se lembrou, em vez disso, de sua mente repassando eventos passados ​​em detalhes perfeitos. E por alguma chance do destino, isso significava que ela se lembrava da entidade, e ela se lembrava de esquecê-la, por mais paradoxal que isso fosse.

E ela nunca falaria sobre isso com ninguém.

Ela & # 8217d matou os soldados que mantinham as outras crianças de sua vila como reféns. Depois da primeira, ela fingiu medo, fingiu que os guerrilheiros estavam na mata. Então ela esperou o momento em que eles estivessem muito ocupados observando a floresta e matou o resto dos homens com um rifle de assalto. Ela nem se sentiu mal com isso, nem perdeu muito o sono por uma das crianças, Behar, ter sido baleada na escaramuça.

Ela lamentava as mortes, nem era preciso dizer, mas não se sentia culpada por isso. Dos dez deles, sete conseguiram voltar, por causa dela e de seu dom. Eles voltaram para sua aldeia, tiraram os corpos de vista e fizeram o que puderam para conservar a comida até que os guerrilheiros voltassem.

Hana tinha feito os outros jurarem não falar de seu presente. Ela sabia que os guerrilheiros iriam recrutá-la, usá-la, se soubessem. Seja qual for o poder que ela recebeu, ela não sentiu que fosse para isso.

Quando os combatentes voltaram, viram o estado das crianças e decidiram evacuá-las. Os lutadores os levaram para uma cidade, e um homem lá viu que Hana e os outros foram enviados para o Reino Unido, para onde muitos outros refugiados estavam indo. Eles se separaram e os outros foram enviados um a um para lares para órfãos e outras crianças com problemas. A curva de Hana e # 8217 chegou tarde, quase a última, e ela foi levada para voar em outro avião para sua nova casa. Foi aí que ela teve dificuldades. Ela & # 8217d passou pela arcada & # 8211 o que mais tarde ela descobriria ser um detector de metais & # 8211 e soou um alarme. Os guardas encontraram a arma que ela não podia largar ou deixar para trás, e Hana foi carregada para outro lugar. Interrogado, fez muitas perguntas. Ela foi levada ao banheiro, revistada em sua reentrada na sala de interrogatório, e eles encontraram a mesma arma com ela que haviam levado apenas meia hora atrás.

Todo o resto aconteceu muito rápido, depois disso. Foi um americano com uniforme militar que a resgatou. Ele a levou para a América, viu que ela foi colocada com uma família lá. Quando as três primeiras equipes Wards foram estabelecidas, ela foi alistada. Ela mal sabia cem palavras em inglês, seus números e o alfabeto, quando ela saiu vestida pela primeira vez.

Hannah se curvou sobre a pia e lavou o rosto. Ela encontrou uma escova de dentes e escovou os dentes, depois passou fio dental e raspou a língua. Muito fácil esquecer essas coisas, sem o ritmo do sono para interromper a continuidade dos dias. Melhor fazer essas coisas com um pouco de frequência, do que esquecer. Ela gargarejou com enxaguatório bucal, depois mostrou os dentes para ver o dentista trabalhar, onde ele os tampou. Dentes perfeitamente modelados, brancos. Não realmente dela.

Sua arma encontrou o caminho para sua mão em algum momento depois que ela colocou o enxaguatório bucal, uma arma não muito diferente da primeira forma que tinha assumido para ela. Ela o girou em torno do dedo pelo guarda-mato algumas vezes antes de guardá-lo no coldre ao sair do banheiro. Ela foi até a janela e olhou para a cidade do outro lado da água. As cores mudaram sutilmente na luz refratada do campo de força do PHQ & # 8217s, saturando a visão como uma TV com configurações de imagem ruins.

Mesmo que ela nunca tenha sonhado, a América ainda tinha uma qualidade surreal, onírica. Era tão distante de onde ela tinha vindo, tão diferente. Não houve guerra aqui, não realmente, e ainda assim as pessoas aqui conseguiram encontrar muito do que reclamar. Homens de terno, problemas de amor, cuidados médicos e não ter o telefone touchscreen de última geração. Essas queixas muitas vezes carregavam mais emoção e fervor do que qualquer pessoa em sua aldeia costumava lamentar a morte de entes queridos ou a erradicação metódica de seu povo. Quando ela ouviu as reclamações de seus amigos e colegas de trabalho, ela simplesmente balançou a cabeça e deu as palavras de simpatia necessárias.

Luzes brilhantes e conveniências e falta de nada e televisores e carros esportivos e dentes tampados e chocolate e a lista continuou & # 8230. Ela levou quase uma década para começar a se acostumar com isso, e tudo mudou tão rápido que qualquer vez que ela pensava que estava entendendo, havia algo novo, algo que ela deveria saber ou entender.

Ela aceitou sem reclamar quando seus pais adotivos lhe disseram para começar a escrever seu nome na forma mais americana & # 8216Hannah & # 8217. Ela & # 8217d concordou e assinou os papéis quando eles pegaram o sobrenome que seus pais lhe deram e o substituíram pelo seu próprio. Coisas pequenas, tão insignificantes, em comparação com o que ela tinha visto e feito. It didn’t bear complaining about. Everyone praised her for how dutiful she was in school and her training. She never gave up, never quit. Why should she? This was nothing compared to those hours she spent in that forest.

So hard to believe that the events from her dream had occurred just twenty six years ago.

It never felt entirely real. More than once, she had let herself begin to believe she’d died, that she’d taken that step forward and never made it out of the forest. She had made mistakes when she let herself think that way, had put herself in too much danger, back in her earliest years as a hero. Now, when she found herself slipping into that mindset, she often tried to sleep. Her memories as she slept were perfect, unblemished, almost more real than real life, which was why she never did it too often. Ironic, given how necessary it often was, to keep her grounded in reality.

She’d grown to love this country. Truly love it, for what it stood for. She’d had to fight to wear the flag as part of her costume. America wasn’t perfect, but nothing touched by human hands could be. There was greed, corruption, selfishness, pettiness, hatred. But there were good things too. Freedoms, ideas, choices, hope and the possibility that anyone could be anything, here, if they were willing to strive for it. As she accepted her new country, she let herself make friends, boyfriends, let herself get close to her parents and their church. By the time she started college, her accent had all but disappeared, and she knew enough to at least pretend to know what others were talking about when they spoke of pop culture, music and television.

People were judgmental, she knew, and so she would never speak of what she had seen in that moment she received her gift.

Even among other faithful, she would be met with suspicion and scorn, were she to say she’d seen God, or one of His warrior angels, such as they existed beyond the scope of human understanding. That He had given her this ability so she could save herself. Others would offer different interpretations, argue that He had given such gifts to bad people, too, they would point to the science of it. Maybe some small part of her suspected these hypothetical individuals were right. Still, she preferred her faith to uncertainty. The notion that this thing she had seen was something other than a benign entity watching over humanity, that it might be malign, or even worse, that it existed with no conception of the effect it had on mankind? An elephant among gnats? It wasn’t a comfortable thought.

She glanced at the clock 6:30 in the morning. She draped her flag-printed scarf loosely around her neck and lower face, then left her room. The energy became an assault rifle hanging at her side, bouncing a comforting beat against her hip as she walked. She made her way up a flight of stairs and down to the end of a hallway.

She heard a male voice, a female one. She paused at the open doorway and knocked.

“Yeah?” Armsmaster called out.

She stepped into the room. It fell somewhere between a workshop and an office. Two spare suits stood at one side of the room, each with minor functional differences. A set of Halberds were placed on a rack behind Armsmaster’s desk, one shattered in pieces. One of the spaces on the rack was empty – Armsmaster had the Halberd in front of him.

“You worked too hard and forgot to go to sleep again, Colin?” Hannah asked, though the answer was obvious.

He frowned, reached over to his computer and hit a button. He saw the time, muttered, “Damn it.”

“Good morning, Miss Militia,” a woman’s voice came from the computer.

Hannah blinked in surprise, “Dragon. Sorry, I didn’t realize you were there. Good morning.”

“You’re up early,” Dragon commented. “And you were out late, from what I’m seeing on the web. Trouble sleeping?”

“I don’t sleep,” Hannah confessed. “Not really, since I got my powers.”

Colin leaned back and rubbed his eyes with the heels of his hands, “I’d give my left foot for that little perk.”

Hannah nodded. There were others like her? She asked the computer screen, “Do you remember?”

“Sorry? I don’t understand,” Dragon replied.

“Nevermind.” If Dragon fez remember, Hannah knew the answer to that question would have been different. Dragon was too smart to miss the connection.

“We were talking shop,” Colin spoke. He motioned to the Halberd he had in front of him. “Procrastination through Tinker stuff. I think tonight’s project was a success.”

Armsmaster stood, seizing the Halberd in one hand. He pressed a button on the handle, and the blade blurred. Without even swinging the weapon, he let the heavier top end fall against an empty stainless steel mannequin that might have held a spare suit of his armor. Dust blossomed where the blade touched the mannequin, and it passed through without resistance. Pieces of the mannequin clattered to the ground.

He pressed a button, and the blur around the blade dissipated in a steel-colored smoke, leaving only the normal axehead top of the weapon.

“Only problems are that it’s vulnerable to forcefields, fire, and other intense energy, and the apparatus takes up too much space in the upper end. Even with my power, it likely means I’d have to do without some of the kit I’ve gotten used to.”

“I trust you’ll figure it out,” Hannah told him. Then with mock sternness, she put her hands on her hips, “Now, no more distracting me. Just what are you procrastinating on?”

Colin ran one of his hands over his short cropped brown hair, sighed. “Right. You have as much say as I do, in this.”

He walked back to his desk and slumped down into his seat. He kicked a screwdriver and a pair of pliers from the corner of the desk to put his feet up, one ankle crossed over the other. Reaching in the opposite direction, he grabbed a stack of folders and let them fall to the desk.

“Piggot has decided to take action in reflection of recent events. Both the Wards and the Protectorate are being restructured.”

Shrugging, Colin told her, “As far as the Wards go, we’re losing Aegis. Piggot and the PRT want to see how he does leading a different team, and the boy’s parents are amenable. He’ll stay in the Wards for a little longer, to suggest he’s younger than he is.”

“It’s a swap. It’ll be Weld from the Boston team.”

“I don’t know him,” Hannah admitted.

“He’s a good kid with a good record,” Dragon chimed in from the computer, “Ferrous biology, absorbs metals through his skin. Strong, tough, good grades across the board, high marks in the tactics simulations. Likable, and a scan of the web shows feedback for him is higher than average, which is impressive, considering he’s one of the Case 53s.”

“He’s got the tattoo?” Hannah asked.

“The mark is branded into his heel, not tattooed, but yes.”

Colin frowned, “We’re supposed to pick two others from our Wards team to transfer to one of the other major teams, nearby. I settled on Kid Win, I’m stuck on the others.”

“Too new. Might be able to sell it to Piggot, but my suspicion is that she’ll think it looks bad, giving up our newbie.”

“Hm. Gallant won’t be able to leave for Boston. Too many logistical issues,” Hannah glanced at the computer. She couldn’t say more.

“You can speak freely,” Colin spoke, “Dragon has either read the record in question, or she’s reading it as we speak.”

“Gallant has local responsibilities, and is expected to start helping with his father’s local business enterprise,” Dragon spoke, giving truth to Colin’s words, “Miss Militia is right, he’s a local fixture. And his girlfriend is here.”

Hannah nodded, “Painful to give up Vista or Clockblocker. They’re our big guns, and they’re local heroes after the role they played in that bomb scare. Shadow Stalker?”

Colin shook his head, “There would be more trouble over handing over someone like Shadow Stalker to another team than there would be if we gave away a newbie like Browbeat. Discipline problems.”

“Still?” she asked. Armsmaster nodded.

Hannah frowned, “Alright. This is what you do, then. Propose Shadow Stalker and Kid Win. If Piggot does refuse Shadow Stalker, and you should make an argument that Shadow Stalker might need a change of scenery, Piggot will have a harder time refusing Browbeat, right after.”

Colin rubbed his chin, where his beard traced the edges of his jaw, nodded.

“If she doesn’t agree to giving away either of the two, and you really should play hardball on that, you can offer Clockblocker. He graduates this summer, anyways, and I’d say he’s got enough friends and contacts here that he might apply to come back to Brockton Bay to join our Protectorate when he turns eighteen. Best case scenario for us, and it’s not like Boston or New York need more capes.”

Colin sighed, “You’re better at this than I ever was.”

Hannah wasn’t sure how to respond. Colin had his strengths, but he was right.

He went on, “Congratulations.” He picked up the second folder and held it out to her.

“What?” She took it, opened it.

“There’s a change to our team, too, according to Piggot and the rest of the oversight. You’ve been promoted. Within the next two weeks, this building and this team will be transferred to your command.”

She stood there, paging through the folder of paperwork, stunned. “Where are you going?”

Hannah broke into a smile, “Chicago! That’s fantastic! A bigger city, a bigger team! Where’s Myrddin being moved?”

Hannah shook her head, “But…” she trailed off.

The hard look on Colin’s face was telling enough.

“It’s the politics,” Colin spoke, leaning back, “I’m good at this. Better than most, if you don’t mind me boasting. Everything I bring to the table, I worked my ass off for. But when it comes to shaking hands, managing people, navigating the bureaucracy… I’m not good at it, won’t ever be. Because of that, I’m getting demoted, and I can probably give up on ever being in charge of another team.”

“I’m sorry. I know how much you wanted-”

“It’s fine,” he said, but it was clear in the curtness and hardness of his tone that it wasn’t. He turned away and touched his keyboard. In the darkness of the room, his face briefly reflected the blue light of the screen. His brow furrowed.

“Dragon. That program you gave me, predicting the patterns of class S threats, remember it? I made a few modifications, to see if I couldn’t catch any highlights, I’m running a dozen of them concurrently. One, I called HS203. I want you to look directly at this. I’ve put it behind some pretty heavy security, but if you wait a second, I’ll-”

“I’m already looking over it,” Dragon interrupted. “I see what you did. Linking my data to atmospheric shifts. I think I see it.”

Hannah walked around the desk and leaned over Colin’s shoulder to see the screen. A map of the east coast was superimposed with a rainbow hued cloud. “This doesn’t mean anything to me.”

“Nothing’s truly random,” Colin explained, his voice tight, “Any data shows a pattern eventually, if you dig deep enough. Dragon started work on an early warning system for the Endbringers, to see if we can’t anticipate where they’ll strike next, prepare to some degree. We know there’s some rules they follow, though we don’t know why. They come one at a time, months apart, rarely hitting the same area twice in a short span of time. We know they’re drawn to areas where they perceive vulnerability, where they think they can cause the most damage. Nuclear reactors, the Birdcage, places recently hit by natural disasters…”

He clicked the mouse, and the image zoomed in on a section of the coastline.

“…Or ongoing conflict,” Hannah finished for him, her eyes widening. “The ABB, Empire Eighty-Eight, the fighting here? It’s coming aqui? Agora?

Colin didn’t have a reply for her. “Dragon? Brockton Bay falls within the predicted zone, and the city é on the list of locations that rate high enough on the sensitivity or negative media scale. Add my data, the correlations between abrupt microshifts in temperature, air pressure and-”

“The data is good.” Dragon’s voice, synthesized to mask the most telling details about her identity, held no trace of doubt.

“Good enough to call for help?”

Colin moved quickly, spinning in his chair to reach a small console. He opened a glass panel and flipped a switch. Air raid sirens immediately began their ominous whine.

“Dragon, I’ll contact Piggot and the Protectorate teams. You get hold of everyone else that matters. You know who’s most needed.”

He turned to Hannah, and their eyes met briefly. Much was communicated between them in that moment, and she wasn’t sure she liked what she saw in his eyes.

“Miss Militia. Recruit the locals. And we need a place to gather.”


Table of Contents

Chapter 2: The Theoretical and Epistemological Foundations of YPAR

Interlude: Discussing the Council’s Origins

Chapter 3: The Pedagogy of Relationships as the Core of YPAR

Interlude: Brokering Relationships in the Council

Chapter 4: Asking Research Questions

Interlude: Reflecting on the Council’s Pedagogy

Chapter 5: Making Methodological Choices

Interlude: Transforming Practice and Identity in the Council

Chapter 6: Becoming Researchers through Data Collection and Analysis

Interlude: Changing Young Lives in the Council

Chapter 7: Producing and Sharing Research

Interlude: Demanding Change in the Council

Chapter 8: YPAR in the Academy

Appendix A: In Their Own Words: Students Explain the Council of Youth Research

Appendix B: 2010 Summer Seminar Reading List

Appendix C: 2010 Summer Seminar Survey Results

Appendix D: Symposium Proposal Submitted to the 2011 Annual Meeting of the American Educational Research Association

Appendix E: Scholarly Publications Authored by Adults Members of the Council about YPAR


The flexible and fast-reacting project management meets our requirements for the short-term nature and speed of market research studies to a particular degree. The quality and proactivity of project support and the speed of reporting implementation also meet the highest standards

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Nadia Chan
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We use QuestionPro&rsquos panel software when we need to get quick answers to complex questions about consumers, our brand, and the markets in which we operate. QuestionPro&rsquos competent and personal support allows us to conduct panel studies at very short notice.


Engaging Crystallization in Qualitative Research

"This is the best book I have read in quite some time. Professor Ellingson writes clearly yet artfully and in a scholarly voice that is accessible to students and faculty alike. The weaving between description and illustrative case studies takes readers through the step-by-step journey of crystallization (as experienced and offered by Ellingson). The book is clearly grounded in philosophies of knowing and methods— yet, it offers practical strategies, questions, and choices for researchers."
— Lynn M. Harter, Ohio University

Engaging Crystallization in Qualitative Research, the first "how to" book to both explain and demonstrate crystallization methodology, offers a framework for blending grounded theory and other social scientific analyses with creative representations of data, such as narratives, poetry, and film. Author Laura L. Ellingson explores relevant epistemological questions that arise when crossing methodological boundaries, provides detailed steps for design and planning, offers guidelines for improving both social scientific and creative/artistic writing, and suggests strategies for targeting publication outlets for multigenre representations.

  • Articulates the principles of crystallization and how it enables researchers to both represent multiple perspectives on a phenomenon and highlight the partial nature of all claims of truth
  • Breaks down the qualitative research barriers between the grounded theorists and those who favor artistic, interpretive, and creative approaches, exemplifying the possibilities for all
  • Demonstrates the rich possibilities for blending social scientific, creative/artistic, and critical approaches to research
  • Provides hands-on strategies that help practitioners and students collect, analyze, and represent qualitative data through crystallization
  • Explores ethical challenges, the political nature of research findings, and the need for social justice activism among researchers
  • Illustrates concepts with exemplars, featuring cutting-edge research in social sciences, education, and allied health

Suitable for experienced practitioners and advanced students of qualitative methods, Engaging Crystallization in Qualitative Research is ideal for such courses as Intermediate/Advanced Qualitative Research, Ethnographic Methods, Grounded Theory, Field Research Methods, and Qualitative Inquiry.


22.1 bcftools

Here, we just want to give everyone the chance to run through a few operations with bcftools , to start to get familiar with its interface. The first thing to note is that, like samtools (which is maintained by the same group of people), bcftools possesses a number of different subcommands. So, the syntax is always like:

Also like samtools , bcftools will take input from stdin rather than from a file—you just pass it - instead of a file name.

The full documentation/manual for bcftools is maintained at: http://samtools.github.io/bcftools/bcftools.html. It is well worth reading through this whole documentation, though it can be quite terse and intimidating. A friendlier “tutorial” introduction to the software can be found at https://samtools.github.io/bcftools/howtos/index.html.

Here we are going to get our feet with with a few operations.

22.1.1 Tell me about my VCF file!

VCF files are a little daunting. Especially when they are gzipped they can seem particularly opaque—learning anything about them in the traditional manner of uncompressing them and then searching for lines within them or counting up the number of records can be time consuming. Here are some bcftools solutions to a few different questions you might have.

Who is in this file? You can always try to find the last header line in a VCF file using grep or awk and parse the individuals out yourself, but it turns out to be faster and safer to use the query subcommand from bcftools with the -l option. Do it here:

Then read about it on the manual page. Find the part that talks describes it.

How many variants are in this file? This question can be answered quickly with bcftools stats , which also returns to you a plethora of information about the variants.

The top part of the output tells you how many SNPs and indels (and other types of variants) there are. Then it tells you about Ts/Tv ratios, allele frequencies and read depths.

Where are these variants? There are several ways to answer this question. One might be simply to print the CHROM and the POS for each row in the VCF file:

If you want to see where it starts and where it finishes you can do:

From that we see that our example file runs from 4 Mb to 7 Mb or so on chromosome NC_037124.1. This shows one use of the subcommand query , which is quite useful.

Give me a glimpse of the file You can use bcftools view for a number of things, but at its simplest, you can merely look at the file in VCF format. (In this manner, it behaves much like samtools view for VCF files).

When we did that, we see that there is a lot of information in the INFO field. What if we wanted to extract that?

22.1.2 Get fragments/parts of my VCF file

Extract keyed values from the INFO field This is another job for bcftools query . You pass a format string to the -f option that tells the program which fields you want to extract and how you want to format it. Check out some examples:

View data from specified regions

What if we want to look at variants only in two 10 Kb regions, like NC_037124.1:5000000-5010000 and NC_037124.1:6000000-6010000 ? Pass those, separated by commas, to the -r option (which is an option that applies to many of the subcommands):

You can also specify those regions in a file with -R option.

View data from specified individuals

You can give the sample names (comma separated) to the -s option:

Or, if you wanted to view all but those two individuals, precede them with a ^ :

You can also supply a text file with sample names (one-per-line) to the capital letter -S option.

You can combine options, like -r and -s , as well.

22.1.3 Combine VCF files in various ways

Catenate VCF files

If you have VCF files called from the same reference genome filled with the same samples, it is easy to catenate the together with bcftools concat :

Note the use of the -O (capital “o”) option to specify the output type: v = VCF, b = BCF, u = uncompressed BCF, z = bgzipped VCF.

Merge VCF files

If you have files with different samples in them you can easily combine them:

22.1.4 Filter out variants for a variety of reasons

There are a lot of ways to filter out variants. bcftools leaves things very general here, and so just about anything is possible. Some simple ones:

Just the biallelic SNPs please Get things with no more than 2 alleles and no fewer than two alleles, and of a type = SNP:

Just the biallelic indels please

Note the use of -Ou in order to pipe uncompressed BCF output directly into bcftools stats using the - for a filename.

Fraction of missing sites less than X

If you want to make sure that 60% of your individuals have at least one read at the genotype, you can do this:

Play with setting the F_MISSING to different values and see how that affects the number of variants retained.


What third parties have access to personal data?

Microsoft will not disclose personal data except:

  1. as the customer directs (including as required to complete phone calls)
  2. as described in the Online Service Terms (such as the use of authorized subcontractors to provide certain components of services)
  3. as required by law.

If law enforcement contacts Microsoft with a demand, Microsoft will attempt to redirect the law enforcement agency to request that personal data directly from the customer. If compelled to disclose personal data to law enforcement, Microsoft will promptly notify the customer and provide a copy of the demand unless legally prohibited from doing so. For more information about data that we disclose in response to requests from law enforcement and other government agencies, please see our Law Enforcement Requests Report.

The Teams Security Guide has more information about our compliance standards.


2. Windows 10 data collection management

Windows 10 provides the ability to manage privacy settings through several different methods. Users can change their privacy settings using the Windows 10 settings (Start > Settings > Privacy) The organization can also manage the privacy settings using Group Policy or Mobile Device Management (MDM). The following sections provide an overview on how to manage the privacy settings previously discussed in this article.

2.1 Privacy setting options for users

Once a Windows 10 device is set up, a user can manage data collection settings by navigating to Start > Settings > Privacy. Administrators can control privacy settings via setting policy on the device (see Section 2.2 below). If this is the case, the user will see an alert that says Some settings are hidden or managed by your organization when they navigate to Start > Settings > Privacy. In this case, the user can only change settings in accordance with the policies that the administrator has applied to the device.

2.2 Privacy setting controls for administrators

Administrators can configure and control privacy settings across their organization by using Group Policy, Mobile Device Management (MDM), or Windows registry settings.

The following table provides an overview of the privacy settings discussed earlier in this document with details on how to configure these policies. The table also provides information on what the default value would be for each of these privacy settings if you do not manage the setting by using policy and suppress the Out-of-box Experience (OOBE) during device setup. If you’re interested in minimizing data collection, we also provide the recommended value to set.

This is not a complete list of settings that involve connecting to Microsoft services. To see a more detailed list, see Manage connections from Windows operating system components to Microsoft services.

Feature/Setting GP/MDM Documentation Default State if the Setup experience is suppressed State to stop/minimize data collection
Speech Group Policy:
Computer Configuration & gt Control Panel & gt Regional and Language Options & gt Allow users to enable online speech recognition services

2.3 Guidance for configuration options

This section provides general details and links to more detailed information, as well as instructions for administrators and compliance professionals. These instructions allow you to manage device settings to manage the compliance objectives of your organization. This information includes details about setting up a device, configuring the device’s settings after setup is complete to minimize data collection, and driving privacy-related user experiences.

2.3.1 Managing the device setup experience

Windows deployment can be configured using several different methods that provide an administrator with options for control, including how a device is set up, which options are enabled by default, and what the user is able to change on the device after they log on.

If you want the ability to fully control and apply restrictions on data being sent back to Microsoft, you can use Configuration Manager as a deployment solution. Configuration Manager can be used to deploy a customized boot image using a variety of deployment methods. You can further restrict any Configuration Manager-specific diagnostic data from being sent back to Microsoft by turning off this setting as outlined in the instructions here.

Alternatively, your administrators can also choose to use Windows Autopilot. Autopilot lessens the overall burden of deployment while allowing administrators to fully customize the out-of-box experience. However, since Windows Autopilot is a cloud-based solution, administrators should be aware that a minimal set of device identifiers are sent back to Microsoft during initial device boot up. This device-specific information is used to identify the device so that it can receive the administrator-configured Autopilot profile and policies.

You can use the following articles to learn more about Autopilot and how to use Autopilot to deploy Windows 10:

2.3.2 Managing connections from Windows components to Microsoft services

Administrators can manage the data sent from their organization to Microsoft by configuring settings associated with the functionality provided by Windows components.

For more details, see Manage connections from Windows operating system components to Microsoft services. This topic includes the different methods available on how to configure each setting, the impact to functionality, and which versions of Windows that are applicable.

2.3.3 Managing Windows 10 connections

Some Windows components, apps, and related services transfer data to Microsoft network endpoints. An administrator may want to block these endpoints for their organization to meet their specific compliance objectives.

Manage connection endpoints for Windows 10, version 1903 provides a list of endpoints for the latest Windows 10 release, along with descriptions of any functionality that would be impacted by restricting data collection. Details for additional Windows versions can be found on the Windows Privacy site under the Manage Windows 10 connection endpoints section of the left-hand navigation menu.

2.3.4 Limited functionality baseline

An organization may want to further minimize the amount of data sent back to Microsoft or shared with Microsoft apps by managing the connections and configuring additional settings on their devices. Similar to Windows security baselines, Microsoft has released a limited functionality baseline focused on configuring settings to minimize the data sent back to Microsoft. However, the functionality of the device could be impacted by applying these settings. The Manage connections from Windows operating system components to Microsoft services article provides details on how to apply the baseline, along with the full list of settings covered in the baseline and the functionality that would be impacted. Administrators that don’t want to apply the baseline can still find details on how to configure each setting individually to find the right balance between data sharing and impact to functionality for their organization.

We recommend that you fully test any modifications to these settings before deploying them in your organization.

2.3.5 Diagnostic data: Managing notifications for change of level at logon

Starting with Windows 10, version 1803, if an administrator modifies the diagnostic data collection setting, users are notified of this change during the initial device sign in. For example, if you configure the device to send optional diagnostic data, users will be notified the next time they sign into the device. You can disable these notifications by using the Group Policy: Computer Configuration & gt Administrative Templates & gt Windows Components & gt Data Collection and Preview Builds & gt Configure telemetry opt-in change notifications or the MDM policy ConfigureTelemetryOptInChangeNotification .

2.3.6 Diagnostic data: Managing end user choice for changing the setting

Windows 10, version 1803 and newer allows users to change their diagnostic data level to a lower setting than what their administrator has set. For example, if you have configured the device to send optional diagnostic data, a user can change the setting so that only required diagnostic data is sent by going into Settings & gt Privacy & gt Diagnostics & feedback. Administrators can restrict a user’s ability to change the setting using Configuração & gt Privacy by setting the Group Policy: Computer Configuration & gt Administrative Templates & gt Windows Components & gt Data Collection and Preview Builds & gt Configure telemetry opt-in setting user interface or the MDM policy ConfigureTelemetryOptInSettingsUx .

2.3.7 Diagnostic data: Managing device-based data delete

Windows 10, version 1809 and newer allows a user to delete diagnostic data collected from their device by using Settings & gt Privacy & gt Diagnostic & feedback and clicking the Delete button under the Delete diagnostic data heading. An administrator can also delete diagnostic data for a device using the Clear-WindowsDiagnosticData PowerShell cmdlet.

An administrator can disable a user’s ability to delete their device’s diagnostic data by setting the Group Policy: Computer Configuration & gt Administrative Templates & gt Windows Components & gt Data Collection and Preview Builds & gt Disable deleting diagnostic data or the MDM policy DisableDeviceDelete .


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